Linha do Tempo: 2003 a 2008
Data desconhecida de 2003
Antes dos acontecimentos de A Extinção:
Janeiro de 2003 - O T-Vírus se alastra por todo o mundo
A Infecção continua a se espalhar apesar da destruição de Raccoon City. Dentro de semanas, todos os Estados Unidos é infectado, dentro de alguns meses o mundo todo, com Tóquio, no japão sendo o ponto-chave do surto. Toda a biosfera é afetada, e o planeta esta logo destruído por zumbis.
Fevereiro de 2003 - Alice invade a sede de computadores da Umbrella
Após a captura de Jill e a morte acidental de Angela, Alice se separa de Carlos porque a Umbrella está rastreando sua localização. Ela vai a uma instalação da Umbrella e desativa o sistema de rastreamento dos computadores, afim de ficar fora do rastreamento.
Data desconhecida de 2008
Inicio dos acontecimento de Resident Evil 3: A Extinção
Data desconhecida de 2008 - Cinco anos após a invasão a sede da Umbrella
Cinco anos depois da invasão a instalação da Umbrella, Alice anda nos arredores de Salt Lake City, onde em uma lojinha ela encontra um diário que aparentemente aponta para uma zona segura chamada Arcadia. Dr. Isaacs continua a trabalhar no projeto Alice, criando clones delas, enquanto ele tenta duplicar os poderes dela. Ele também está tentando domesticar os zumbis, mas pra isso, precisa do sangue de Alice. Wesker diz que Alice é uma prioridade.
Data desconhecida de 2008 - Re-encontro de Alice e Carlos Oliveira
Carlos e LJ se encontraram durante o Apocalipse e agora se juntaram a um comboio que é liderado por Claire Redfield. Durante esse tempo LJ é mordido, mas esconde isso dos outros. O comboio de Claire e atacado por corvos que foram infectados pelo vírus, quando Alice chega e com seus poderes, queima todo o céu, queimando os corvos. Mas ela faz um erro, fazendo com que Isaacs descubra sua localização e passe a segui-la novamente.
Data desconhecida de 2008 - Bem vindos a Las Vegas...
Após a salvação dos sobrevientes, e por ter usados seus poderes, Alice fica inconsciente. Depois de acordar ela conhece Claire e ré-conhece seus amigos Carlos e LJ, e os fala sobre Arcadia. os membros do comboio concordam em ir para o Alasca(onde fica Arcadia) com Alice. Mas durante uma pausa pra pegar gasolina em Las Vegas(Ou oque ainda resta dela) Isaacs descobre que Alice esta lá, e manda um helicóptero cheio de mortos vivos, que estão mais fortes e mais rápidos, até Las Vegas. Durante o ataque dos zumbis o comboio sofre muitas baixas, incluindo LJ que havia sido mordido no motel e finalmente morre, e finalmente ataca seu amigo Carlos, que é mordido.
Depois do ataque em Las Vegas, Alice vai atrás de Isaacs que esta bem perto deles, mas quando chega lá, Isaacs já estava no helicóptero, e ele acaba sendo mordido por um de seus zumbis evoluídos. Ele se injeta com o anti- vírus após a mordida, mas os efeitos o fazem se transformar em um Tyrant, uma criatura monstruosa, quase imbatível, quase...!!
Os sobreviventes vão até onde está o helicóptero de Isaacs, par usa-lo até sua viajem ao Alasca, Alice e os outros descobrem que Carlos está infectado, e se despedem, Alice o beija. Para ir até o helicóptero, eles tem que passar por muitos zumbis, então Carlos vai se sacrificar, se jogando nos zumbis com um caminhão e explosivos, Carlos se explode, e da uma chance para os sobreviventes passarem. Alice precisa matar Isaacs e descobrir onde ele está, então fica para trás. Claire e os outros voam para o Alasca.
Data desconhecida de 2008 - A Descoberta dos Clones e Morte de Isaacs
Alice encontra uma instalação subterrânea da Umbrella abaixo de uma cabana. Lá ela vê que todos os cientistas e soldados da Umbrella estão mortos. Então a Rainha Branca aparece e a explica que Isaacs saiu do controle e matou todos na instalação. Alice encontra o Tyrant e o enfrenta, mas ela logo leva um porrada dele. Ele está preste a derrotar ela, mas logo é fatiado pelos lasers do corredor. Graças a uns dos clones de Alice. Na instalação de Tóquio, Wesker diz a todo o conselho que esta retomando a pesquisa de Isaacs. Alice aparece via holograma e anuncia que está indo atrás deles. E com amigos. Alice descobriu dezenas de Clones.